پیچیدگی ها ، مشترکات مفصل در تجزیه و تحلیل ژنتیک گسترده

A massive undertaking involving more than 1,300 scientists from 37 countries reported in 23 papers shows the results of analyzing 47 million genetic changes in 2,600 genomes of 38 different tumor types. یک کار گسترده با بیش از 1300 دانشمند از 37 کشور جهان گزارش شده در 23 مقاله ، نتایج آنالیز 47 میلیون تغییر ژنتیکی در 2600 ژنوم از 38 نوع مختلف تومور را نشان می دهد. The Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) presented what the researchers called “the most comprehensive study of whole cancer genomes to date.” آنالیز پان-سرطان ژنومهای كامل (PCAWG) آنچه را كه محققان "جامع ترین مطالعه ژنومهای سرطانی كامل تا به امروز" نامیده اند ارائه كرده است.
محققان با بهره گیری از آخرین فن آوری های توالی و انفورماتیک محاسباتی ، به 16 گروه کاری تقسیم شدند و درهای پیچیده ژنتیکی و مشترکات موجود در سرطان را باز کردند و بینشهایی را ارائه دادند که می تواند باعث کشف بیشتر و درمانهای نهایی شود.
PCAWG analyzed whole genomes rather than the more common approach of sequencing only protein-coding regions. PCAWG ژنوم های کامل را به جای روش رایج تر توالی فقط مناطق کد کننده پروتئین مورد تجزیه و تحلیل قرار داد. They produced 1,188 tumor transcriptomes to link RNA and DNA alterations and explored genetic drivers, tumor signatures, and virus DNA found in cancers. آنها برای پیوند بخشیدن به تغییرات RNA و DNA ، تعداد 188 ترانسكریپتوم توموری تولید كردند و درایورهای ژنتیکی ، امضاهای تومور و DNA ویروس موجود در سرطان را كشف كردند. These analyses generated more than 800 terabytes of data, roughly equivalent to the storage required for 200,000 movies. این تجزیه و تحلیلها بیش از 800 ترابایت داده تولید کردند ، تقریبا معادل ذخیره سازی مورد نیاز برای 200000 فیلم.
PCAWG found cancer-driver mutations for 95% of cases, and that on average each cancer genome has four or five drivers. PCAWG در 95٪ موارد جهشهای ناشی از سرطان را یافت و بطور متوسط ​​هر ژنوم سرطان چهار یا پنج راننده دارد. Sizable minorities of cancers showed signs of chromoplexy (17.8%) or chromothripsis (22.3%), reflecting complex and chaotic rearrangement processes. اقلیت قابل توجهی از سرطان علائم کروموپسی (17.8٪) یا کروموتریپسیس (22.3)) را نشان داد ، که فرآیندهای بازآرایی پیچیده و آشفته را نشان می دهد. The researchers found that genetic changes leading to cancer occur early on—sometimes decades in advance of diagnosis. محققان دریافتند که تغییرات ژنتیکی منتهی به سرطان در اوایل و در بعضی اوقات دهه ها قبل از تشخیص رخ می دهد.
The investigation also uncovered genetic drivers in noncoding DNA, like noncoding regions of the tumor-suppressor gene TP53 and of the telomerase gene TERT. این تحقیقات همچنین از رانندگان ژنتیکی در DNA غیر کد کننده ، مانند مناطق غیر کد کننده ژن سرکوبگر تومور TP53 و ژن تلومراز TERT پرده برداشت. Another PCAWG team characterized mutational signatures using more than 84 million somatic mutations from 4,645 whole-genome and 19,184 exome sequences to describe 81 signatures including single- doublet- and clustered-base-substitutions as well as small insertion-and-deletion signatures, many not previously identified. یک تیم PCAWG با استفاده از بیش از 84 میلیون جهش جسمی از 4،645 کل ژنوم و 19184 توالی عالی برای توصیف 81 امضا شامل تعویض های تک و دو برابر- و خوشه بندی شده- و همچنین تعویض های کوچک درج و حذف ، مشخص کننده امضاهای جهش یافته است. قبلاً مشخص شده In a first, another team identified 16 structural variants involving large rearrangements. در مرحله اول ، تیم دیگری 16 نوع ساختاری را که شامل بازآرایی های بزرگ بود ، شناسایی کرد.
تجزیه و تحلیل ویروس های مرتبط با سرطان ، شیوع ویروس اپشتین بار ، ویروس هپاتیت B و ویروس پاپیلومای انسانی را برجسته کرد.
All the PCAWG papers, published in Nature and related journals, are open access at nature.com/collections/afdejfafdb. تمام مقالات PCAWG ، که در مجله های Nature و نشریات مرتبط منتشر شده اند ، دسترسی به دسترسی آزاد در سایت Nature.com/collections/afdejfafdb دارند. The researchers' raw genome sequencing data and other resources also are available to researchers. داده های توالی ژنوم خام و سایر منابع محققان نیز در دسترس محققان است.
سموم مواد افیونی کودک در نوجوانان ، نوجوانان
About one-quarter of opioid poisonings occur in children and adolescents, and poisoning incidents have become more severe in recent years, according to an abstract presented at the Society of Critical Care Medicine's annual congress. براساس چکیده ای که در کنگره سالانه انجمن مراقبت های بحرانی ارائه شده است ، حدود یک چهارم مسمومیت های مواد افیونی در کودکان و نوجوانان رخ می دهد و حوادث مسمومیت در سال های اخیر شدیدتر شده است. The retrospective study of more than 750,000 opioid poisoning cases reported to the National Poison Data System from 2005 to 2018 found that 27.5% (207,543) of cases occurred in patients younger than age 19. مطالعه گذشته نگر بیش از 750،000 مورد مسمومیت با مواد افیونی که از 2005 تا 2018 به سیستم ملی سموم داده گزارش شد ، نشان داد که 27.5٪ (207.543) موارد در بیماران جوانتر از 19 سال رخ داده است.
Trend analysis over three eras (2005–2009, 2010–2014, and 2015–2018) showed that the percentage of patients admitted to critical care units and deaths increased over time; تجزیه و تحلیل روند در طول سه دوره (2005-2009 ، 2010–2014 ، و 2010–2018) نشان داد که درصد بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه و مرگ و میر با گذشت زمان افزایش یافته است. 6.6%, 8.5%, and 9.6% and 0.18%, 0.20%, and 0.28%, respectively. 6/6٪ ، 8.5٪ و 6/9٪ و 18/0٪ ، 0.20٪ و 0.28٪ به ترتیب. The probability of having a moderate or major effect also rose, by 0.55% and 0.11%, respectively. همچنین احتمال بروز اثر متوسط ​​یا عمده نیز به ترتیب 0/55 درصد و 11/0 درصد افزایش یافته است.
مسمومیت با مواد مخدر به قصد خودكشی در سه دوره زمانی افزایش یافته است ، از 13.9٪ به 21.2٪.
محققان در گزارشی منتشر شده جداگانه ، دو توزیع اوج سن را برای مسمومیت با مواد افیونی ، در کودکان از نوزادان تا 4 سالگی و در نوجوانان 15 تا 19 سالگی مشاهده کردند.
بخش هاي اضطراري بيش از همه امتحانات براي تظاهرات آميزي ريوي
به گفته نویسندگان ، آنژیوگرافی ریوی توموگرافی کامپیوتری (CTPA) در کار تشخیصی آمبولی ریوی (PE) بیش از حد مورد استفاده قرار می گیرد و تأکید می کند "نیاز فوری به انتشار و اجرای پروتکل ها برای کاهش اسکن CTPA با عملکرد کم" از جمله آزمایش D-dimer. یک مطالعه به بررسی شیوه های بخش اورژانس (ED) مربوط به آزمایش مرتبط با PE (نتایج ارزیابی های Qual Circuit Cardiovasc2020 ؛ 13: e005753).
The study, a cross-sectional analysis of electronic health record and billing data from 16 EDs in Indiana and 11 hospitals in the Dallas-Fort Worth area, identified ED patients who underwent any of the following, including D-dimer testing, CTPA, scintillation ventilation perfusion lung scanning, or pulmonary angiography. این مطالعه ، تجزیه و تحلیل مقطعی سوابق الکترونیکی سلامت و داده های صورتحساب از 16 ED در ایندیانا و 11 بیمارستان در منطقه دالاس-فورت ورث ، بیماران مبتلا به ED را که تحت هر یک از موارد زیر تحت آزمایش قرار گرفته اند ، از جمله آزمایش D-dimer ، CTPA ، اسکتیلاسیون شناسایی کرد. اسکن ریه پرفیوژن تهویه ، یا آنژیوگرافی ریوی. Out of 1.83 million patient encounters, 5.3% had a diagnostic test for PE. از میان 1.83 میلیون مواجهه بیمار ، 5/5٪ آزمایش PE را داشتند. Nearly 60% of all patients who had tests for PE underwent CTPA without D-dimer testing. تقریباً 60٪ از کلیه بیمارانی که تست PE داشتند ، تحت آزمایش D-dimer قرار گرفتند. About 21% of CTPA took place in women younger than age 45, who are at greater risk of cancer from CTPA radiation exposure, according to the authors. به گفته نویسندگان ، حدود 21٪ از CTPA در خانمهای جوانتر از 45 سال رخ داده است ، که در معرض خطر ابتلا به سرطان در معرض تابش CTPA هستند.
عملکرد تشخیصی جمع آوری شده از CTPA برای PE 3.1، ، با 1.3 rate در EDS در ایندیانا و 4.8 rate در امکانات دالاس-فورت Worth بود.
بیماران در ایندیانا کمتر از کسانی که در دالاس-فورت ورث حضور داشتند ، آزمایش D-dimer را قبل از CTPA (30٪ در مقابل 52٪ ، به ترتیب) دریافت کردند ، احتمالاً منعکس کننده تأثیر یک ابتکار عمل ارتقاء کیفیت هدفمند است که در دالاس-فورت ارزش گرفته بود. برای افزایش استفاده از آزمایش D-dimer در بیماران کم خطر
The data imply that “D-dimer ordering correlates with an increased yield rate of PE on CTPA,” wrote the investigators. محققان نوشتند که داده ها حاکی از آن است که "سفارش D-dimer با افزایش میزان عملکرد PE در CTPA ارتباط دارد". “This relationship suggests but does not prove a positive cause-effect relationship between rate of D-dimer ordering and PE yield.” "این رابطه حاکی از وجود رابطه علت و معلولی مثبت بین میزان سفارش D-dimer و عملکرد PE نیست."